博物馆里的展品非常丰富,有包含病理学、生物学,还有一些古代医疗工具的展品。穆特博物馆是根据一个人名所起的,当时他在欧洲学医回来之后就在费城的教授外科进行手术,他也是在麻醉剂发明之后最后一个使用他的人,他坚持消毒操作是整形医学的先锋,比较擅长修复一些畸形或者是疤痕之类。在他50岁死于痛风之后,就将他的大部分标本,还有一些医疗设备都捐给了当时的费城医学院建立了这所穆特博物馆。这个博物馆可谓是重口味人士的天堂,里面的收藏现在已经超过2万件,但向公众展示的只有15%。
在博物馆中收藏的有几本人皮书,因为博物馆旁边就是历史医学图书馆,那里面的人皮书是现在全球存最多的。当时有一个女性死于毛线虫病,在尸体解剖过程中,大腿皮肤保留了下来做成了三本有关于女性分娩的医学书。里面收藏的部分藏品都是一些人体标本,有些标本是泡在甲醛中,一些标本很脆弱所以储存标本的罐子需要一直转动,在这些标本中,里面最吓人的一个就是生下来就没有头骨的婴儿。
还有很多高加索人的头骨被按在了墙上,在他们的头骨下都写有名字、出生地和死因。还收藏了很多的人体标本,其中有很多的连体婴儿,最独特的是一个双头婴。就连爱因斯坦的大脑切片也在这所博物馆中。