杭姓主要有三大起源，一是源自鲁国大夫亢父，后人以亢父氏为姓，后来通假字演化为抗姓、杭姓等。二是源自卫国大夫三伉，古时杭与伉、抗等通假。三是源自大禹庶出子孙，受封于浙江滂水，又称为余航，于是子孙以航为姓，后抹掉舟偏旁，形成杭姓氏族。
1. 源自亢父
杭姓最主要起源来自姬姓，在春秋时期，鲁国有一个贵族受封于亢父，也就是今天的山东省济宁市，这里也是军事重地，所以人们也称这个贵族叫做亢父，他的后裔子孙也就以祖先的封地为姓，最终形成了亢父氏，不过因为古时候有四个字通假，比如亢、抗、伉等，所以最终才形成了杭姓，并且世代相传。
2. 源自三伉
根据《元和姓纂》可知，卫国大夫三伉氏的后人就是杭姓始祖之一，三伉原本是今天河南省鹤壁市的地名，因为古时候“伉”和“抗”“亢”等相通，所以三伉氏的后裔中就出现了抗氏，而其中抗喜就当上了汉中太守，东汉时期的泰山太守杭徐就是抗氏一族，为了看起来文雅，他的子孙也就改为杭姓，最终传承至今，形成了现代云阳地区的杭姓氏族。
3. 源自大禹庶系子孙
根据《姓氏考略》可知，大禹的庶出子孙有部分受封于浙江的滂水，而这里也称之为“余航”，位于扬州境内，据说当时是因为大禹完成治水后，留下了不少船只，而大禹就将九州内所有的船只交给了庶子，最终也就在余航封国，后来这个庶子的后裔也就将“航”中的舟去掉，最终改为了杭姓。
4. 源自少数民族改姓
与赵姓起源和来历一样，杭姓中也有不少源自少数民族改姓，其中包括了蒙古族、满族等，最为典型的就是蒙古族，比如族中的哈勒斌氏、杭津氏以及杭阿覃氏等改为了杭姓，还有满族中的杭满氏、完颜氏以及章佳氏等也都是杭姓的始祖。
