然而,虽然各地区巫山北鲵的体型差异不大,但雌雄体形却相反,比如这种鱼的磁性体魄是要比雄性大长一些的,但是生物学家也很难解释这是为什么而形成。
终于是在三十年前生物学家确定了巫山北鲵为模式种,但其有效性一直是一个有争议的问题。自1990年以来,许多科学家已经证明新疆北娃娃鱼确实有实验室繁殖,而新疆北娃娃鱼与巫山北娃娃鱼的差异并不大,它们可能是同一事物,不同的名称,因此娃娃鱼属的有效性受到质疑。1999年编制《中国两栖动物地图集》时,未将该属列入。
但后来的研究证明,蝾螈应该是有效的,有很多生物学证据,但巫山北蝾螈真的不属于蝾螈,它属于蝾螈,巫山北蝾螈因此被从属中剔除,有了自己的模式种但令人惊讶的是,这个属真的存在。2006年,随着科学技术的进步,终于对于他们的基因组合排序进行了研究,并指出大鲵与北方大鲵在遗传距离上存在巨大差异,明显不是同一属,大鲵的存在终于得到了官方的确认。